Владимир Нильсен обучался в Петроградской консерватории в классе органа под руководством Исая Браудо. Период его обучения по этой специальности охватывал 1927–1931 годы.
Исай Браудо являлся одним из ключевых педагогов Нильсена в годы его учебы в консерватории. Владимир Нильсен упоминается в числе наиболее известных и выдающихся учеников Исая Браудо.
