Шарль Куперен был братом Луи Куперена. Луи Куперен был старшим сыном в семье, а Шарль — одним из его младших братьев.
В день Рождества 1661 года Шарль Куперен получил шестилетний контракт на смену своего покойного брата Луи Куперена в церкви Сен-Жерве.
