Луи Куперен был старшим братом Шарля Куперена, отца Франсуа Куперена. Таким образом, Франсуа Куперен приходился Луи Куперену племянником.
Во французской музыкальной династии Куперенов Луи Куперен упоминается как дядя Франсуа Куперена; отец Франсуа, Шарль Куперен (1639—1679), был младшим братом Луи и после него занял место органиста церкви Сен-Жерве в Париже.
