Маргарита Федорова навчалася у класі Генріха Нейгауза з 8-го класу Центральної музичної школи після того, як Є. К. Ніколаєва показала її Нейгаузу. У 1951 році вона з відзнакою закінчила Московську консерваторію, а в 1951—1955 роках навчалася в аспірантурі в класі Генріха Нейгауза.
Генріх Нейгауз був педагогом Московської консерваторії, а Маргарита Федорова названа серед учнів його класу.